مقدمه ای از کتاب هایپرکم Hyperchem ابزاری برای مدلسازی مولکولی
فهرست مطالب کتاب هایپرکم Hyperchem ابزاری برای مدلسازی مولکولی
بخش اول: اجراي برنامه و معرفي ابزار موجود در محيط هايپركم
- 1-1 اجرای برنامه
- 2-1 معرفی امكانات موجود در محیط هایپرکم
- 3-1 کلیدهای میانبر جهت دسترسی آسانتر به امکانات و ابزار موجود در نرمافزار هايپركم
- 4-1 معرفی شکل و كاربرد هر يك از ابزارهای موجود در هايپر كم
- 5-1 رسم یک مولکول
بخش دوم: محتويات منو و عملكرد هر يك از گزينههاي آن
كاربرد گزينههاي موجود در منوي File
- 1-2-1 Menu / File / New
- 1-2-2 Menu / File / Open
- 1-2-3 Menu / File / Merge
- 1-2-4 Menu / File / Save
- 1-2-5 Menu / File / Save As
- 1-2-6 Menu / File / Start Log
- 1-2-7 Menu / File / Stop Log
- 1-2-8 Menu / File / Log Comments
- 1-2-9 Menu / File / Import
- 1-2-10 Menu / File / Export
- 1-2-11 Menu / File / Print
- 1-2-12 Menu / File / Preferences
- 1-2-13 Menu / File / Exit
2-2 كاربرد گزينههاي موجود در منوي Edit
- 2-2-1 Menu / Edit / Clear
- 2-2-2 Menu / Edit / Cut
- 2-2-3 Menu / Edit / Copy-
- 2-2-4 Menu / Edit / Copy Isis Sketch
- 2-2-5 Menu / Edit / Paste
- 2-2-6 Menu / Edit / Copy Image
- 2-2-7 Menu / Edit / Invert
- 2-2-8 Menu / Edit / Reflect
- 2-2-9 Menu / Edit / Rotate
- 2-2-10 Menu / Edit / Translate
- 2-2-11 Menu / Edit / Zoom
- 2-2-12 Menu / Edit / Z Clip
- 2-2-13 Menu / Edit / Align Viewer
- 2-2-14 Menu / Edit / Align Molecules
- 2-2-15 Menu / Edit / Set Bond Length
- 2-2-16 Menu / Edit / Set Bond Angle
- 2-2-17 Menu / Edit / Set Bond Torsion
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Build
- 3-2-1 Menu / Build / Explicit Hydrogens
- 3-2-2 Menu / Build / Default Element
- 3-2-3 Menu / Build / Add Hydrogens
- 3-2-4 Menu / Build / Model Build
- 3-2-5 Menu / Build / Allow Ions
- 3-2-6 Menu / Build / United Atoms
- 3-2-7 Menu / Build / All Atoms
- 3-2-8 Menu / Build / Calculate Types
- 3-2-9 Menu / Build / Compile Type Rules
- 3-2-10 Menu / Build / Set Atom Type
- 3-2-11 Menu / Build / Set Mass
- 3-2-12 Menu / Build / Set Charge
- 3-2-13 Menu / Build / Constrain Geometry
- 3-2-14 Menu / Build / Constrain Bond Length
- 3-2-15 Menu / Build / Constrain Bond Angle
- 3-2-16Menu / Build / Constrain Torsion
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Select
- 4-2-1 Menu / Select / Atoms
- 4-2-2 Menu / Select / Residues
- 4-2-3 Menu / Select / Molecules
- 4-2-4 Menu / Select / Multiple Selections
- 4-2-5 Menu / Select / Select Sphere
- 4-2-6 Menu / Select / Select All
- 4-2-7Menu / Select / Complement Selection
- 4-2-8 Menu / Select / Select
- 4-2-9 Menu / Select / Name Selection
- 4-2-10 Menu / Select / Extend Ring
- 4-2-11 Menu / Select / Extend Side Chain
- 4-2-12 Menu / Select / Extend To Sp3
- 4-2-13 Menu / Select / Back Bone
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Display
- 5-2-1 Menu / Display / Select To Fit
- 5-2-2 Menu / Display / Overlay
- 5-2-3 Menu / Display / Show All
- 5-2-4 Menu / Display / Hide Selection
- 5-2-5 Menu / Display / Show Selection Only
- 5-2-6 Menu / Display / Rendering
- 5-2-7 Menu / Display / Last Rendering
- 5-2-8 Menu / Display / Show Isosurface
- 5-2-9 Menu / Display Isosurface
- 5-2-10 Menu / Display Show Hydrogen /-
- 5-2-11 Menu / Display Periodic Box
- 5-2-12 Menu / Display Show Multiple Bond
- 5-2-13 Menu / Display Show Hydrogen Bond
- 5-2-14 Menu / Display / Recomputed H Bonds
- 5-2-15 Menu / Display / Show Inertial Axes
- 5-2-16 Menu / Display / Show Dipole Moment
- 5-2-17 Menu / Display / Labels
- 5-2-18 Menu / Display / Color
- 5-2-19 Menu / Display / Element Color
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Data Bases
- 6-2-1 Menu / Data Bases / Amino Acids
- 6-2-2 Menu / Data Bases / Make Zwitterions
- 6-2-3 Menu / Data Bases / Remove Iconic Ends
- 6-2-4 Menu / Data Bases / Nucleic Acids
- 6-2-5 Menu / Data Bases / Add Counter Ions
- 6-2-6 Menu / Data Bases / Mutate
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Setup
- 7-2-1 Menu / Setup / Molecular Mechanics
- 7-2-2 Menu / Setup / Semi Empirical
- 7-2-3 Menu / Setup / Ab Initio
- 7-2-4 Menu / Setup / Network
- 7-2-5 Menu / Setup / Periodic Box
- 7-2-6 Menu / Setup / Restraints
- 7-2-7 Menu / Setup / Set Velocity
- 7-2-8 Menu / Setup / Select Parameter Set
- 7-2-9 Menu / Setup / Compile Parameter File
- 7-2-10 Menu / Setup / Reaction Map
كاربرد گزينههاي موجود در منوي Compute(منوي محاسبات)
- 8-2-1 Menu / Compute / Single Point
- 8-2-2 Menu / Compute / Geometry Optimization
- 8-2-3 Menu / Compute / Molecular Dynamics
- 8-2-4 Menu / Compute / Langevin Dynamics
- 8-2-5 Menu / Compute / Monte Carlo
- 8-2-6 Menu / Compute / Vibrations
- 8-2-7 Menu / Compute / Transition State
- 8-2-8 Menu / Compute / plot molecular properties
- 8-2-9 Menu / Compute / Orbitals
- 8-2-10 Menu / Compute / Vibrational Spectrum
- 8-2-11 Menu / Compute / Electronic Spectrum
- 8-2-12 Menu / Open script
- 8-2-13 Menu / Cancel
دیدگاهها0
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.